O Mestrado Acadêmico em Ciência e Tecnologia de Alimentos da Universidade do Estado de Santa Catarina (UDESC) iniciou em março de 2016, após recomendação da CAPES em 2015. Nesse curso, há a possibilidade de complementação da formação de profissionais das áreas afins à Ciência e Tecnologia de Alimentos, com o objetivo de exercício das atividades de docência em nível superior, fortalecimento da pesquisa científica e tecnológica, consultoria e trabalhos especializados em empresas e no setor público. Atualmente há no programa 13 docentes da Universidade do Estado de Santa Catarina, que atuam em duas linhas de pesquisa:
1 - Desenvolvimento e otimização de tecnologias, produtos e processos;