A Secretaria dos Conselhos Superiores (Secon) é um órgão suplementar superior, com estrutura própria, vinculado ao Gabinete do Reitor e subordinado às Presidências dos Conselhos, com o Secretário designado pelo Reitor. A Secon tem como função a elaboração e publicação dos documentos que expressam as deliberações dos Conselhos, atendimento técnico aos presidentes dos Conselhos, a diretores, coordenadores, conselheiros, departamentos e setores diversos quanto à legislação emitida e assuntos afetos ao setor.