A Udesc possui dezenas de laboratórios e grupos de pesquisa certificados pela instituição e cadastrados no CNPq, em áreas como ciências agrárias; ciências biológicas; ciências da saúde; ciências exatas e da terra; ciências humanas; ciências sociais aplicadas; engenharias; linguística, letras e artes, contribuindo significativamente para o progresso científico, tecnológico, cultural e econômico do estado de Santa Catarina e do Brasil.
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